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COVID-19的研究

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COVID-19研究的八位平台概述

在福特乐动体育买球生物,我们就下决心要支持科研人员在全球范围内努力寻找急需的治疗方法和疫苗对SARS-COV2病毒。作为我们承诺的一部分,我们已经编译链接和资源的更多信息,包括如何我们的八位系统已经在资源选项卡最近的出版物中使用。由于COVID-19序列在1月份第一共享,八位系统数据已被刊登在相关的冠状病毒生物学,疫苗和抗病毒治疗发展的几个突破出版物。

以下摘要表提供了其中八位系统阐明结合动力学和亲和力,中和,COVID-19病毒颗粒的交叉阻断或滴度发挥了作用的一些重要研究文章。随着新的信息之后,我们会更新这个页面上此表等信息,提供最新信息。

分析物

固定配体(S)

病毒种

分析焦点

生物传感器

参考

ACE2

FC-标记的SARS冠状病毒-2 RBD

SARS-CoV-2

交叉反应性和受体结合

AHC

[1]

ACE2

SARS-COV-2 SSARS冠状病毒小号

SARS-CoV-2

受体结合

HIS1K

[2]

单抗,MERS S蛋白,VHH

SARS冠状病毒-2 S1,SARS冠状病毒-2 RBD

SARS-CoV-2

VHH和mAb结合评估,表位框

AR2G

[3]

FAB,IgG抗体

SARS冠状病毒-2 S蛋白,SARS冠状病毒-2 RBS

SARS-CoV-2

FAB,IgG结合表征

HIS1K

[4]

ACE2,SARS-CoV的RBD

SARS冠状病毒特异性中和抗体

SARS-CoV-2

交叉反应性结合

SA

[5]

抗体

生物素的重组SARS冠状病毒S1蛋白

SARS-CoV-2

中和抗体评估

SA

[6]

FAB,ACE2,SARS S蛋白

单克隆抗体,ACE2

SARS-CoV-2

受体结合,抗体的反应性,竞争测定

AHC,HIS1K

[7]

SARS冠状病毒-2 RBD

抑制肽

SARS-CoV-2

肽抑制剂的发展

SA

[8]

单抗

S1与SARS小号外生

SARS冠状病毒和SARS冠状病毒-2

抗体反应性评估

HIS1K

[9]

SARS冠状病毒-2 RBD,SARS冠状病毒RBD,单克隆抗体,FAB

单克隆抗体,SARS冠状病毒-2 RBD,SARS冠状病毒RBD

SARS冠状病毒和SARS冠状病毒-2

抗体结合特性,表位装箱,竞争结合

A蛋白,HIS2,HIS1K

[10]

冠状病毒蛋白S

生物素9OAc6SLN

SARS冠状病毒和冠状病毒MERS

受体结合

SA

[11]

MERS-5HB融合抑制剂

生物素 - 肽(MERS-HR2P)

MERS冠状病毒

蛋白抑制剂的开发

SA

[12]

单抗,MERS S蛋白

单抗,MERS S蛋白

MERS冠状病毒

表位框和受体结合

SAX,蛋白A

[13]

MERS-CoV的小号

单克隆抗体

MERS冠状病毒

抗体反应性测试,竞争分析

AHC,HIS1K

[14]

MERS-CoV的NTD,突变体

单抗

MERS冠状病毒

抗体反应性测试

AHC

[15]

MERS S蛋白

单克隆抗体

MERS冠状病毒

抗体反应性测试

AHC

[16]

RBD,S1,S2域

疫苗诱导的小鼠单克隆IgG的

MERS冠状病毒

抗体反应性和表位装箱

AHC,HIS1K

[17]

晶圆厂

MERS-CoV的RBD

MERS冠状病毒

表位框

HIS1K

[18]

结合动力学特性

英等。人。来自复旦大学,上海,与他人在病毒学武汉研究所合作,据说评价抗SARS冠状病毒抗体的交叉反应与2019-nCoV刺突蛋白,考虑受体结合域在2019年相对较高的同源性(RBD)-nCoV和SARS冠状病毒。他们报道首次使用福特生物八位系统上获得的数据,即一个SARS冠状病毒特异性的人单克隆抗体,CR3022,可以用20乐动体育买球19-nCoV RBD(6.3纳米的KD)结合有效地。这样的结果是有效的抗病毒治疗和疫苗最终的发展是至关重要的。

类似意见,Joyce等的报道。人。使用SARS-CoV的-2 S RBD的高分辨率晶体结构。物已知与SARS-CoV的和冠状病毒MERS RBD相互作用的抗体用于使用八位系统SARS-CoV的-2结合活性进行了测试。只有两种抗体,240CD和CR3022出池显示针对SARS-CoV的RBD 2低纳摩尔结合亲和力。

英等。人。在复旦大学发表的另一篇文章描述的产生和单域抗体靶向SARS-COV-2 RBD的测试。使用SARS-CoV的-2 RBD和S1作为抗原导致抗体对SARS-CoV的-2靶向RBD五种类型中和或非中和表位的识别摇摄。选择其中的十八继续深造。它们有效地和特异性结合于该SARS-CoV的-2 RBD以亚纳摩尔至纳摩尔亲和力如通过生物薄膜干涉(BLI)和ELISA测量

病毒结合和交叉反应的快速测定

在他们的单域抗体靶向SARS-COV-2 RBD,英等人的文章。人。测试18人单结构域抗体在使用八位系统竞争结合测定和发现他们可以被分成三个竞争组(组A,B或C),其没有表现出任何彼此竞争。

洞察COVID-19结合表位

世界各地的生物薄膜干涉(BLI)技术帮助科学家更多地了解最近的冠状病毒(COVID-19)爆发。在这个传单,我们强调两个许多情况下,研究人员正在使用的Octet®系统了解该病毒的绑定机制作为疫苗的开发的第一步。

快速和高精度的流感疫苗的效价测定

在制造过程中的快速和疫苗效价的精确确定是在理解疫苗开发过程性能是重要的,并用于正确地缩放每个工艺步骤。该八位位组平台结合高通量在精度和再现性的改进的96孔或384孔板格式的特征,并从更简单和更直接的疫苗/抗原 - 抗体结合的测量方法导出。他们提供工艺开发组,一个强大的和易于使用的替代方法SRID。BLI减少了测定时间从几天到只为样本的96孔板几个小时。

适配子集团使用八位字节Red384准确的结果

研究过去的几个月里已经凸显SARS冠状病毒-2蛋白S1作为治疗铅的目标。适体组的一个小组成功地分离能够选择性结合SARS冠状病毒-2尖峰的S1蛋白的单克隆适体。他们用八位Red384测试针对SARS冠状病毒-2及相关病毒的适体,并以确定绑定的蛋白质在不同位点的适体。阅读更多...

资源COVID-19的研究

在Covid-19全球研究日常由世界卫生组织(WHO)收集和更新。

艾伦研究所AI与领先的研究小组合作,准备和分发病毒的COVID-19开放研究数据集(CORD-19),超过52,000学术文章的免费资源,包括超过41000全文,约COVID-19和冠状病毒家族由全球研究界使用。网上,全文搜索的数据库可以在下面的链接进行访问。也可以执行搜索出版物参考使用福特生物产品在病毒研究的。LDsports金融投注乐动体育买球

开放来电资询和研究人员等支持,非营利组织和商业组织,专门为COVID-19和冠状病毒相关研究的一个组织列表进行维护和每日更新。

美国国立卫生研究院(NIH)列出了所有的冠状病毒相关的融资机会。

应用笔记一种快速高精度流感疫苗效价测定

商场分子和肽治疗药物后疾病研究的大部分地区备受追捧,由于其理想的药理特性和倾向低免疫原性。在小分子药物发现中,路径引导分子可从许多来源或开始点,包括筛选片段,高通量筛选,从头的结构设计,等等的确定和评估小分子的结合治疗性靶标的亲和力的茎是药物发现过程和铅优化的显著组成部分。命中到引线和引线的优化过程是必不可少的,以精确地确定在体外生物效价,使得结构 - 活性关系(SAR)可用于有效的结构设计。了解八位RED96e,八位RED384,八位HTX和先锋SPR平台如何被用于表征小分子和肽系统。

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应用笔记在八位HTX系统交叉竞争或表位框的测定

在早期药物开发,交叉竞争测定法用于表征数百抗体克隆的,并且可以与杂交瘤上清液,噬菌体裂解物或纯化的样品上进行。因为在不同的箱结合不同的表位的单克隆抗体,并显示不同的功能特性,表位装箱研究可以增加选择具有所需生物活性的前导抗体的可能性。交叉竞争测定法也被执行以鉴定结合相似的表位以一个先前表征的mAb,如生物仿制药或biobetters的产生单克隆抗体。这些测定法还可以是在选择的试剂为夹心ELISA或式测定法,诸如那些用于生物标记测试或药效学测定法是有用的,该抗原结合的同时识别良好抗体对。

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应用笔记八位位组效价测定:开发,确认与验证策略

在本应用笔记中,我们讨论了使用Octet®系统中效价测定的开发和验证的策略。我们已经展示了方法的开发和验证策略评估的Fcγ受体III分子广泛表征NISTmAb的结合突出了八位系统的易用性ofuse和快速获得结果。

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传单最近的见解COVID-19结合表位

该新型冠状病毒,COVID-19,已被宣布为流感大流行由世界卫生组织(WHO)。一旦扩散,研究人员正在动员了解病毒的绑定机制作为疫苗的开发的第一步。下面是最近的出版物强调见解,这些约束机制的例子。

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信息图表了解COVID-19疫苗和治疗性发展研究

研究从Covid-19感染和疫苗产生的抗体可以提供invaluableinformation对治疗性抗体的研发和工程。亲和力,动力学和表位的相互关系是在疫苗和治疗设计的重要因素。

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信息图表检测SARS-COV-2抗体的血清和血浆样品

恢复期血浆疗法正在调查一个潜在的治疗,其中从患者的康复抗体进行输血当前COVID-19例,意在帮助他们对抗感染和购买时间,直到他们的免疫系统产生抗体。然而,并不是所有的人回收具有适合于这种输血抗体滴度的相同的量。可靠,简单和快速的方法需要评估血浆样品中的相对的抗体效价。

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出版物结构,功能和SARS-COV-2 S蛋白的抗原性

珊C.墙壁,等人,PII:S0092-8674(20)30262-2细胞2020三月

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出版物针对MERS_CoV人类中和抗体的鉴定及病毒的适应性进化的作用

汤XC,等人,111(19):E2018-26,国家科学院院刊美A.,2014年5月

在这份报告中,作者筛选使用新颖的平移战略,以确定对中东呼吸综合征冠状病毒(MERS冠状病毒)引起与〜43%的死亡率严重呼吸道疾病7中和抗体的人抗体噬菌体库。他们进一步明确关键残基影响受体结合,病毒性健身,并中和效应导致对基于人类单克隆抗体 - 免疫治疗新的可能性。结合研究使用抗FLAG生物传感器上月RED96进行。

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出版物在SARS-CoV的-2和SARS冠状病毒的受体结合结构域高度保守表位的隐蔽

梦缘,等人。2020年三月

COVID-19,这是由SARS-COV-2病毒引起的爆发,继续在全球蔓延,但目前了解甚少在病毒表位。在这项研究中,我们已经确定在复合物中的SARS-CoV的-2钉(S)蛋白的受体结合结构域(RBD)与CR3022,先前从SARS恢复期患者分离的中和抗体的晶体结构。CR3022靶向高度保守表位,使交叉反应性SARS-CoV的-2和SARS-CoV的之间的结合。结构建模进一步表明,当在三聚S蛋白至少两个其中,RBD在“向上”的构象的结合位点,才可以访问。总体而言,这项研究提供结构和分子洞察SARS-COV-2的抗原性。

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出版物泉Zhua拉尔夫S. Baricb,C,2,和Wayne A. Marascoa,2。针对MERS冠状病毒的人类中和抗体的鉴定及病毒的适应性进化的作用

冼春坦噶,等人。,111(19)E2018-E2026,PNAS 2014年5月13日

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出版物一种有效的sarbecovirus中和抗体的结构和功能分析

多拉·平托等人,2020年4月

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出版物免疫球蛋白片段的F(ab”)2抗RBD有效地中和SARS-CoV的-2在体外

小燕潘等人,2020年4月

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出版物抗F抗体糖蛋白抑制尼帕和亨德拉病毒感染

。荡HV等人,26(10):980-987,纳特STRUCT分子生物学杂志。2019年10月

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出版物上的N-末端结构域的中和表位的结构性定义MERS-CoV的刺突糖蛋白

。海霞周等,10,商品编号:3068,自然通讯2019

对中东呼吸综合征冠状病毒(MERS-CoV的)最性中和抗体靶向刺突糖蛋白的受体结合结构域(RBD),并阻断其结合至细胞受体二肽基肽4(DPP4)。单克隆抗体靶向非RBD区域的表位和机制还没有得到很好的特点呢。这里,我们报告的单克隆抗体7D10结合的刺突糖蛋白并抑制MERS冠状病毒以高效力的细胞进入的N-末端结构域(NTD)。结构测定和诱变实验揭示了NTD的表位的关键残基的7D10结合和中和。进一步的实验表明,通过7D10中和不完全依赖于DPP4的结合的抑制,但病毒细胞附着后也作用,抑制了预融合到尖峰的后融合的构象变化。这些特性给7D10广泛中和广度,并帮助解释其与一些RBD靶向抗体的协同效应。

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出版物对于人类冠状附件唾液酸受体结构基础

M.亚历杭托尔托里奇。,等人,26,pages481-489,自然结构与分子生物学杂志2019

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出版物向解决MERS_protective人mAb靶向的不同结构域和功能的MERS冠状刺突糖蛋白

。常春藤聪等人,8(1):516-530,新兴微生物与感染2019

中东呼吸综合征冠状病毒(MERS冠状病毒)是一种人畜共患的病毒,会引起严重的致命的呼吸系统疾病的人。努力开发基于抗体的疗法集中于中和靶向受体结合的病毒刺突蛋白从而阻断受体结合的结构域抗体。在这里,我们制定了一套针对功能的MERS冠状病毒刺突蛋白的不同结构域的人单克隆抗体。这些抗体属于六种不同的表位组,并与MERS-CoV的刺突蛋白的三个关键条目的功能的干扰:唾液酸结合,受体结合和膜融合。与被动免疫有效地以及与不良性中和抗体从致命MERS-CoV的挑战,保护小鼠。总的来说,这些抗体提供了新的方法通过针对不同的刺突蛋白的抗原表位和功能,以获得在对阵新兴MERS-CoV的人体液的保护。

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出版物冠状病毒融合的意外受体功能模仿阐发激活

墙壁AC,等人,176(5):1026-1039.e15,细胞2019年2月

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出版物中和目标,以避免和逃逸的MERS-CoV棘突多个抗原位点的单克隆抗体的重要性

王L,等人。,92(10)。PII:e02002-17,病毒学Joural,2018年4月

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出版物在融合前构象的2019-nCoV秒杀的冷冻电镜结构

丹尼尔Wrapp,等人。,第367,第6483,第1260至1263年,科学2020年3月13日

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出版物中和目标,以避免和逃逸的MERS-CoV棘突多个抗原位点的单克隆抗体的重要性

灵枢Wang等。,92(10)。PII:e02002-17,病毒学杂志,2018年4月

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出版物由SARS冠状病毒特异性的人单克隆抗体2019新型冠状病毒刺突蛋白的有效结合

。小龙田等人,9(1):382-385,Emerg(紧急)微生物传染。2020

新发现的2019新型冠状病毒(2019-nCoV)已经引起着1.19万多家实验室确诊的人感染,其中259人死亡,对人的健康构成严重威胁。然而,目前没有具体的抗病毒治疗或疫苗。考虑到受体结合域(RBD)的2019-nCoV和SARS-CoV的相对较高的认同,这是迫切需要评估抗SARS冠状病毒抗体的交叉反应与2019-nCoV刺突蛋白,这可能有重要意义疫苗和治疗性抗体针对2019-nCoV的快速发展。在这里,我们报告的第一次,一个SARS冠状病毒特异性的人单克隆抗体,CR3022,可以用2019-nCoV RBD(6.3纳米的KD)结合有力。CR3022的表位不重叠与内2019-nCoV RBD的ACE2结合位点。这些结果表明,CR3022可能被开发为候选治疗,单独或联合其它的中和抗体,2019年,nCoV感染的预防和治疗的潜力。Interestingly, some of the most potent SARS-CoV-specific neutralizing antibodies (e.g. m396, CR3014) that target the ACE2 binding site of SARS-CoV failed to bind 2019-nCoV spike protein, implying that the difference in the RBD of SARS-CoV and 2019-nCoV has a critical impact for the cross-reactivity of neutralizing antibodies, and that it is still necessary to develop novel monoclonal antibodies that could bind specifically to 2019-nCoV RBD.

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出版物黄病毒的抑制作用Targetinga保守口袋上的病毒包膜蛋白。细胞化学生物学

。德Wispelaere M等人,25(8):1006-1016.e8,细胞化学生物学,2018年8月

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出版物SARS-COV-2和SARS-CoV棘突-RBD结构与受体结合的比较和中和抗体和疫苗开发的潜在影响

春云孙等人,2020年2月

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出版物Ultrapotent人中和抗体谱抗中东呼吸综合征冠状病毒从康复者

。钮P,等人,218(8):1249年至1260年,杂志传染病,2018年9月

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出版物的人单克隆抗体阻断SARS-CoV的-2感染

春燕王等人。2020年三月

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出版物在APN相关的冠状病毒进入活动网站抑制剂的影响。

明尼苏达M.S.的Y.Cai,大学论文。2017年6月

氨肽酶N(APN)已被示出为几个冠状,如冠状-229E,TGEV,CCoV和FeCoV的受体。苯丁抑制素和放线酰胺素是能阻断APN的酶活性抑制剂。这些抑制剂结合到APN的催化位点,而病毒结合至APN的外表面。这里,我们调查APN抑制对蛋白质 - 蛋白质结合,受体表达和冠状病毒进入机制。我们发现,这些化合物能抑制APN和冠状病毒刺突之间的蛋白质 - 蛋白质相互作用;这些抑制剂还可以调节APN RNA和蛋白的表达;另外,这些化合物可以抑制冠状-229E的在一定水平的假病毒进入人类细胞。另外,冠状病毒刺突处理的人细胞显示在APN表达的减少。这种现象可能揭示细胞的适应不同处理和条件。我们的研究可以提供抗病毒治疗新的潜在战略。

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出版物所述第一的一流的肽结合至SARS-CoV的-2刺突蛋白

G. Zhang等人。2020年三月

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出版物一种新型抑制剂的鉴定对中东呼吸综合征冠状病毒的病毒

太阳Y,等人。,9(9)。PII:E255,病毒2017年9月

中东呼吸综合征冠状病毒(MERS冠状病毒)在2012年首次分离,并与高死亡率的全球流通。MERS冠状病毒的不断爆发突出了开发抗病毒治疗的重要性。在这里,我们合理设计的一种新的融合抑制剂命名MERS五个螺旋束从中通过膜融合的方法形成的六螺旋束(MERS-6HB)衍生的(MERS-5HB)。MERS-5HB由七肽重复1(HR1)三个拷贝和七肽重复2(HR2),而MERS-6HB包括每个HR1和HR2的三个拷贝的两个副本。因为它缺少一个HR2,MERS-5HB预计与病毒HR2相互作用中断融合的一步。我们发现的是,MERS-5HB可以结合HR2P,从HR2衍生肽,具有很强的亲和力值(ķd)高达0.24纳米。随后的测定表明,MERS-5HB可以用约1μM的50%抑制浓度(IC 50)有效地抑制假MERS-CoV的条目。此外,MERS-5HB显著抑制尖峰(S)糖蛋白介导的以剂量依赖的方式合胞体的形成。进一步的生物物理表征表明,MERS-5HB是一个热稳定的α螺旋二级结构。MERS-5HB的抑制效力可以提供针对MERS-CoV的新颖的抑制剂的识别一个有吸引力的基础上,作为一个潜在抗病毒剂。

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出版物漏洞的受体结合SARS-COV-2 S蛋白的域名一个神秘网站

M.戈登乔伊斯等人2020年三月

SARS-COV-2是造成大流行严重的呼吸系统疾病,COVID -19-几个月的初始标识中的一种人畜共患的病毒。媲美的第一SARS-CoV的,这个新的冠状病毒的表面钉(S)通过人ACE-2受体介导的糖蛋白进入细胞,并且因此,是用于疫苗和免疫治疗剂的发展的主要目标。在SARS-COV-2 S糖蛋白仍然是有限的分子信息。在这里,我们以最高分辨率报告SARS-COV-2 S受体结合域(RBD)的晶体结构至今,1.95的。我们确定了一组具有交叉反应性SARS-CoV的-2 RBD等乙型小号糖蛋白SARS-反应性的单克隆抗体的产生。这些抗体中的,CR3022,先前显示协同作用与靶向于SARS-CoV的RBD的ACE-2结合位点和降低病毒逃逸容量抗体。我们确定CR3022的结构中,在复杂的与SARS-CoV的-2 RBD,并且定义了高度跨betacoronaviruses中保守的广谱反应性表位。该表位是在“关闭”融合前S结构人迹罕至,但在“开放”构象进行访问。在复杂的人类抗体与SARS-COV-2和这套抗体的保守乙型表位的广泛反应的这第一次决议将允许候选疫苗的抗原性评估,并为加速疫苗,免疫治疗和诊断的框架针对SARS冠状病毒-2和相关的β-冠状病毒策略。

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出版物为MERS冠状病毒疫苗候选的评价办法

王L,等人,28; 6:7712,自然通讯,2015年7月

中东呼吸综合征冠状病毒的出现(MERS冠状病毒)为严重呼吸疾病亮点的原因需要有效的方法来冠状病毒疫苗的研制。努力独立专注于病毒刺突(S)糖蛋白的受体结合结构域(RBD)可能不优化的中和抗体(NAB)应答。在这里,我们表明,基于全长度S DNA和S1亚基蛋白免疫原引发健壮血清中和活性对小鼠和非人灵长类几个MERS-CoV的菌株。血清学分析和鼠单克隆抗体的分离表明,免疫接种引发的NAb到RBD和,S1和S2亚单位的非RBD部分。多个中和机制进行了通过求解的NAb-RBD复合物的原子结构,通过中和逃逸病毒测序和通过构建MERS-CoV的S代表血清学检测变体证明。针对MERS冠状病毒引起的肺炎影像学猕猴赋予保护的免疫,使用计算机断层扫描来评估,支持这一战略作为MERS冠状病毒疫苗研制有前途的方法。

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应用概述八位位组生物薄膜干涉系统:推进冠状病毒的疫苗和治疗方法的发展

数百万人已经与全球病毒感染和死亡数十万的报道。流感大流行,并没有许可的治疗或疫苗为疾病的迅速发展流行病学在加快发展的干预。

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